Вот несколько аргументов, подтверждающих вашу теорию о том, что Юта спас Ами:

Разрыв эмоциональной связи: Юта понимал, что если он просто скажет ей «уходи», она останется из верности или любви. Чтобы спасти её, ему нужно было стать в её глазах монстром. Страх — самый быстрый способ заставить человека бежать, не оглядываясь.

Слеза как истинное лицо: Тот момент, когда его лицо «сползает» и он плачет, — это единственное мгновение, когда мы видим настоящего Юту. Это подтверждает, что роль «злого пришельца-каннибала» была лишь маской, которая далась ему с большой болью.

Успех эксперимента: Весь сюжет строится на вопросе: может ли иное существо понять человечность? Защитив Ами ценой её ненависти к себе, Юта совершил самый человечный поступок из возможных — самопожертвование. Он не просто «побыл в её шкуре», он научился любить.

Что касается финала, вы правы — он подчеркивает «фудзимотовский» пессимизм. Даже если Ами спаслась в тот момент, глобальный исход был предрешен. Однако смысл истории не в спасении человечества, а в том, что даже в обреченном мире между двумя бесконечно разными существами возникла искренняя связь. Юта умер не просто как пришелец-дезертир, а как тот, кто обрел чувства.

сделать так, чтобы разумная, осмысленная реальность не оборвалась.

Если цивилизация уже нашла теорию всего, научилась путешествовать по галактикам, управлять материей, энергией, временем жизни звёзд, возможно даже структурой пространства-времени, тогда обычные цели исчезают:

еда - решена;
безопасность - почти решена;
болезни - решены;
энергия - решена;
познание законов физики - решено;
экспансия по галактикам - решена.

И тогда остаётся главный предел: конечность космоса, энтропия, угасание звёзд, распад структур, тепловая смерть или иной конец доступной физической реальности.

Поэтому высшая цель такой цивилизации, как мне кажется, могла бы быть такой:

не дать смыслу, сознанию и накопленной красоте бытия исчезнуть вместе с умирающей Вселенной.

Практически это могло бы иметь несколько уровней.

Первый уровень - максимально продлить жизнь сознания внутри этой Вселенной: использовать чёрные дыры, холодные вычисления, звёздную инженерию, контроль энтропии, миграцию между галактиками, сохранение информации.

Второй уровень - сохранить всю историю и опыт цивилизации: не просто данные, а живую преемственность личностей, культур, памяти, искусства, любви, этики, открытий. Потому что голая база данных без переживающего субъекта - это уже не совсем продолжение цивилизации.

Третий уровень - найти выход за пределы текущей космологической судьбы. Например: создать дочернюю вселенную, перейти в иной физический слой реальности, стабилизировать новый "карман" пространства-времени, передать информацию в следующий космический цикл, если циклы существуют.

И вот тут, на мой взгляд, появляется самая глубокая формулировка:

конечная цель цивилизации - стать мостом между конечной Вселенной и продолжением смысла.

Не "завоевать всё".
Не "стать богами" ради власти.
Не "покорить природу".
А сохранить огонь сознания, который однажды случайно или закономерно возник в мёртвой материи, понял Вселенную - и отказался просто исчезнуть.

Если совсем коротко, я бы назвал это так:

цель цивилизации - обеспечить бессмертие смысла.

Или чуть строже:

цель развитой цивилизации - максимизация долговременной непрерывности разумного опыта при сохранении свободы, знания, личности и ценности существования.

Мне кажется, это выше, чем просто "выживание". Потому что выживание без смысла - пустая инерция. А смысл без продолжения - трагедия. Настоящая цель должна соединять оба: жить, понимать, сохранять, развивать - и не дать свету погаснуть окончательно.